为满足广大孕妇、患者和医生的需求,产前诊断中心率先开展胎儿全外显子组测序(WES),结合染色体微缺失微重复(CNV)检测,是一种近乎全基因组检测的遗传病临床解决方案,对于罕见的疑难病例或家族谱系病例提供了一种更为有效、性价比更高的首选检测手段。

 

Ø 检测适应症

 

超声提示结构异常的孕妇于孕10-14周或18-24周进行绒毛穿刺或羊膜腔穿刺,或流产物也可送检。

 

Ø 检测流程

 



Ø 检测费用

 

检测费用为11100元(包括手术穿刺费、染色体微缺失微重复检测、全外显子组检测)

 

 Ø 特色服务

 

全流程自主完成,针对家系检测,两年内提供免费再分析服务,提高阳性率。

 

 

 

 

全外显子组检测具有哪些优势?
 

 

  Ø诊断率大幅提升,诊疗时间有效缩短。

 

诊断率的提升不仅意味着更多疾病可以得到确诊,更多患者可以查明病因,更意味着接下来对于疾病进行的干预或再妊娠指导更加有效和具有针对性。对于临床诊疗而言,诊断率的提升意义深远。

 

遗传性疾病往往表型复杂,且涉及多脏器多系统。传统的检测手段在罕见病的诊断方面,一直存在局限性。

 

基因Panel通常根据表型判定,来选择特定疾病相关Panel进行基因检测,然而临床异质性的存在,会导致基因突变的基因型和临床症状相关性不明确,这就为疾病诊断造成了极大的不确定性。此外,临床医生对于疾病表型的判断能力也会大大影响罕见病诊断率。研究发现,针对特定表型设计的基因Panel,对异常基因的检出率仅有20%左右[1]。

 

全外显子组检测则不受表型影响,可一次性检测与大多数疾病相关的基因变异,让临床医生快速获知致病原因及相关的基因变异情况,提高阳性检出率,缩短诊疗时效。研究发现,全外显子组检测的阳性检出率可提升至30-60%[1

]。

图1:全外显子组检测与基因Panel检出率对比

 

Dillon等发现,将145名高度怀疑为遗传性疾病或具有复杂性表型的儿科患者进行Panel与全外显子组检测,结果显示:WES的检出率达54%(78/145),但对于其中已检出的57例,基因Panel仍有23%(13/57)未检出[1]。

 

2019年1月发表于《柳叶刀》杂志的论文以染色体核型检测和染色体微阵列检测为参照通过大样本量的前瞻性队列研究,筛选了527个患有结构异常胎儿的孕妇家系,结果表明在染色体核型检测和染色体微阵列检测无法确定胎儿结构异常根本原因的情况下,全外显子组测序技术可以起到重要的进一步确诊的作用,以帮助对孕妇进行产前遗传咨询和孕前管理[2]。

 

因此,相较于传统检测技术(Panel检测)20%左右的诊断率,依托高通量测序平台的全外显子组检测的诊断率高达50%,可对复杂性遗传病有更准确的检测与分析结果,更能够帮助患者得到及时、精准的诊断以及准确的遗传咨询。

 

 

 Ø再分析带来多重附加收获,性价比更优

 

全外显子组检测不仅能对既有疾病进行检测,并且随着研究深入以及大数据积累,还能通过数据再分析来发现未知疾病的致病基因或新发突变位点,从而在诊断率提升、数据增值、CNV检出效益、新基因发现、潜在风险变异、迟发性疾病诊断、药物基因组学等方面具有极其重大的意义[3]。

 

Wright等研究发现,2014年通过对1,133名患有严重发育障碍的儿童及其父母进行全外显子组检测,结果显示诊断率为27%。 随着数据库更新(如新基因的发现)、数据分析方法的改进以及临床表型的增加,Wright团队于2018年重新对1,133名患者及其父母的全外显子组数据进行重分析,结果对454名先证者进行了全部或部分诊断,诊断率提升至40%[4]。可见,为受检者提供再分析服务,将会进一步提高临床诊断率。

 

此外,全外显子组检测可以一次检测人类基因组中约20,000个目标基因,避免由于尝试不同的诊断方式而造成的高额经济成本和时间成本。无论是罕见的复杂疾病,亦或是家族谱系病例,全外显子组检测均是更为有效、性价比更高的首选检测手段[3]。

 

参考文献

1.Dillon, O.J., et al., Exome sequencing has higher diagnostic yield compared to simulated disease-specific panels in children with suspected monogenic disorders. Eur J Hum Genet, 2018. 26(5): p. 644-651.

2.Petrovski, S., et al., Whole-exome sequencing in the evaluation of fetal structural anomalies: a prospective cohort study. Lancet, 2019. 393(10173): p. 758-767.

3.Adams, D.R. and C.M. Eng, Next-Generation Sequencing to Diagnose Suspected Genetic Disorders. N Engl J Med, 2018. 379(14): p. 1353-1362.

4.Wright, C.F., et al., Making new genetic diagnoses with old data: iterative reanalysis and reporting from genome-wide data in 1,133 families with developmental disorders. Genet Med, 2018. 20(10): p. 1216-1223.

 

 

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